Втората част на "Космическите шимпанзета" проследява историята на техно маймуната Комет, която иска да се докаже като достойна космическа маймуна. Комет пътува до планетата Малгор, където се сприятелява с извънземното Киловат. Когато страховитият извънземен Зартог превзема Мисия Контрол, идва време за Комет да покаже на какво е способен. Заедно приятелите си той ще направи всичко възможно, за да унищожи гадняра Зартог.