Jiraiya zemřel a Pein se chystá zajmout Kyuubiho. Příběh se otáčí k Sasukemu, který ve skrýši Akatsuki potkal Itachiho. Teď míří k úkrytu Uchihů, aby si tam s ním vyřídil účty. Cestou je zastaví Kisame a Sasuke musí jít dál sám. Suigetsu s Kisamem zatím zabíjí čas bojem. Mezitím cestu ninjů z Konohy, pronásledujících svého dávného přítele, zastoupil další z členů Akatsuki - Tobi.