Nachdem der erste Schock über ihr unfreiwilles Exil überwunden ist, müssen sich die einzelnen Crewmitglieder nun überlegen, auf welcher Seite sie stehen. Wer wird in Zukunft zu Captain Chaplin und wer wird zu Master Chief Prosser halten? Außerdem gibt es eine neue Bedrohung in Form von US-Kriegsschiffen, die die 200-Meilen-Zone überschreiten. Und auch russische Soldaten versuchen die U.S.S Colorado für ihre eigenen Zwecke zu stehlen.