数码宝贝再次出现在现实世界,而且在日本各地都有!大辅听到小贤住的地方有数码宝贝出现,便决定单独去接小贤。三角龙兽出现在那里,大辅赶到后破坏黑暗之塔并让机甲龙兽去与三角龙兽战斗。然而三角龙兽非常强大,机甲龙兽被打得毫无还手之力。 这时,年轻的玄内出现在众孩子面前,并拿出青龙兽身上的一颗数码珠,放出神圣力量,大家都可以进化成完全体,并且机甲龙兽还进化成帝皇龙甲兽,终于将三角龙兽打败送回数码世界。接着,帝皇龙甲兽又到了日本各地,在半小时内将日本的所有数码宝贝都送回数码世界。全世界的数码大门都打开了,玄内告诉大家只有D-3暴龙机才能将大门打开,于是11个孩子将分别到6个地方,与全世界被选中的孩子一起将数码宝贝送回去。