Az Atlanti-óceán északi részén egy civil kutatóhajó segítséget nyújt egy másik hajó sebesült haditengerészeti tisztjeinek. A különleges műveletek parancsnoksága azzal bízza meg az NCIS csapatát, hogy derítsék ki mi történt. A nyomozás megkezdése után, hamar szorult helyzetbe kerülnek és kénytelenek elbújni, miután terroristákat találnak a fedélzeten.