I nostri eroi stanno facendo colazione quando Skitty scappa e incontra uno Spoink che ha smarrito la perla che adorna la sua testa. Come apprenderanno i ragazzi, se privati della loro perla, questi Pokémon perdono a mano a mano le forze. Ansiosi di salvare questo Pokémon sfortunato prima che sia troppo tardi, i nostri eroi si mettono alla ricerca della perla, confondendola per un sacco di oggetti – e Pokémon – dalla forma sferica. E naturalmente dovranno fare i conti con il famigerato Team Rocket.